《赤道》结局是赤道是彦明跑去找赤道，被赤道杀了之后，肇志仁是赤道的身份就曝光了，后来，国家局的领导去抓（赤道）肇志仁，并在火车上找到了他。
中、韩、港三方面表面目标一致，却各怀目的。崔民浩既要追捕赤道，夺回武器，并且要确保国家机密不能泄露。宋鞍以中国立场，解决香港当前危机，以国力遏止任何境内的恐怖活动。李彦明跟肇志仁面对两国压力，并要处理反恐部队成立以来最大挑战，形势愈形紧张。
时间一分一秒过去，随着信差被捕，武器落入香港警队之手，中韩为拥武器权谁属起争议。另一方面，赤道现身澳门，他开始帮助韩国人，部署夺回武器及报复行动。
阴谋真相逐步嚗光，所有人防不胜防，谁都没有想到这个肇志仁，香港大学物理学教授其实才是真正的赤道，而李彦明最终查到赤道真正身份后被张怡君勒死，后来肇志仁和宋鞍二人为了躲避抓捕行动，逃到了京都，故事到这里也就结束了。
